广州南站到新会的行程时间主要取决于所选择的交通工具。从广州南站出发，前往新会区，最常见的方式是乘坐高铁或汽车。

1. **高铁**：广州南站至新会站之间的高铁线路已开通，运行时间大约在1小时30分钟左右。具体发车时间和班次请通过12306官方网站或相关铁路服务查询最新信息。

2. **汽车**：从广州南站到新会区的长途汽车行程时间大约为3小时左右，具体时间可能因路况和车型不同而有所变化。旅客可通过各大汽车票务网站查询最新的班次信息。

建议旅客根据自身需求和实际情况选择合适的出行方式，并提前做好行程规划，以确保顺利出行。