南宁站到昆明南站乘坐动车的行程大约需要5小时左右。具体耗时会根据实际运行的车次和路线有所变化。南宁站位于广西壮族自治区南宁市，昆明南站则位于云南省昆明市。两地之间的动车线路穿越了广西、贵州和云南三省区，沿途经过多个城市和地区。

动车组列车在行驶过程中，会经过广西壮族自治区的多个站点，如桂林北站、柳州站等，这些站点也为乘客提供了下车游览或转乘的机会。进入贵州省后，列车将继续向南行驶，途径贵阳北站等重要站点。最后进入云南省，到达终点站昆明南站。

需要注意的是，由于铁路运营可能会有调整，因此建议出行前通过官方网站或相关APP查询最新的列车时刻表和票价信息。此外，在计划行程时还需考虑好出发时间以及到达目的地后的交通安排，确保旅途顺利。