永署礁的地理位置位于中国南海的中沙群岛中部，北纬15°24′30″，东经113°50′00″。它是中国南海诸岛中位置较为特殊的一个，处于中沙群岛的中心地带，与西沙群岛、南沙群岛都有一定的距离。永署礁是一个环礁，周围有广阔的珊瑚礁平台，礁盘面积广阔，是重要的海洋生物栖息地之一。地理位置上的重要性使得永署礁在中国的海洋权益维护和海洋资源开发中扮演着重要角色。